動物所研究人員連續發表生物多樣性數據共享方麵建議
科學數據共享越來越引起廣泛地關注和討論,一方麵由於數據共享對於科學本身和“大科學(big science)”的發展至關重要,也由於它是各國政府科學決策的重要議題。在全球變化和環境惡化背景下,為更好地理解和保護地球生物資源,生物多樣性數據的共享顯得尤其重要。2001年,由聯合國環境規劃署和多國政府啟動了“全球生物多樣性信息機構(Global Biodiversity Information Facility,GBIF)”,旨在促進全球生物多樣性數據的共享。雖然近年來有越來越多的大型數據共享計劃被啟動,但包括GBIF在內的眾多計劃存在一定的問題:一是它們“自上而下”的運作模式會忽略眾多科學家們的觀點和看法,從而妨礙數據共享進程;二是需要新的、有效的數據共享模式。
針對這些問題,通過對主要全球性多樣性數據庫的調研,必威精装版app西汉姆联 蚜蟲係統進化研究組的科研人員提出“多樣性數據庫和科學期刊采用聯合數據保存政策”的建議,通過聯合數據保存政策,將研究論文所基於的多樣性數據用較為統一的數據格式整合進數據庫。通過對《Journal of Biogeography》2010年所發表的104篇標明物種和分布數量的論文(全年論文的一半)的統計分析,他們發現這些論文貢獻了12782個物種的367000條分布記錄。這些數據說明一個期刊一年就可以貢獻大量的生物多樣性數據。采用聯合數據保存政策對於數據庫和期刊是雙贏的策略,並將是一個在數據數量和質量上可持續的方法。他們的建議發表於《Trends in Ecology & Evolution》,並引起國際同行的關注和討論(Huang & Qiao, 2011, 2012)。
實際上,作為數據的收集者、發表者和使用者,科學家們的任何意見都應該被科學決策過程充分考慮。為了更好地了解科學家對於生物多樣性數據共享的態度、經驗和期望,黃曉磊和喬格俠進一步聯合必威精装版app西汉姆联 、美國加州大學和加拿大蒙特利爾大學的同行,於2011年7月至9月期間,開展了第一項有關該主題的國際調查研究。調查采用網絡問卷的形式,被邀請參與調查的對象包括生物多樣性和保護生物學領域主要期刊的通訊作者,以及相關領域國際學會的成員。調查引起了科學家們很大的興趣,研究團隊共收到五百多份回複,還收到來自150多位科學家約十八頁的評論。這些回複和評論真正反映了科學家們對於生物多樣性數據共享的觀點,總結和討論該調查結果的論文最近發表在《Conservation Letters》(Huang et al., 2012)。
調查結果顯示大部分科學家都認為數據共享非常重要,並願意分享已發表研究論文的相關多樣性數據,但超過60%的科學家承認不願意共享未發表的原始數據。調查揭示了在生物多樣性領域分享文化並不發達,一些技術和認識障礙包括需要將數據保存在自己手中做更多的分析、同行競爭、缺少足夠的回報、不熟悉相關數據保存機構、缺少簡單方便的數據提交工具、沒有足夠的時間和經費等。科學家最關心的,還是希望能夠從數據分享中獲得相應的回報和利益,比如數據所有權、共同作者身份、更多的引用等。很多被調查者在評論中指出,數據共享應該在科研評價體係中獲得足夠的認可,比如像論文引用一樣,數據集的重新利用或引用也應該獲得相應的對待。對調查結果的統計分析清晰地反映出受到單位或資助機構鼓勵的科學家應該更傾向於分享數據。這個結果暗示研究結構或資助結構對於科學家的分享行為有重要的影響力,來自單位的積極措施將有助於促進數據共享。
大部分被調查者表示願意接受期刊和數據庫的聯合數據保存政策,並表示願意在論文發表後立刻或者在一小段時間內將相關生物多樣性數據共享。這暗示多樣性數據庫和期刊采用聯合數據保存政策的方法值得推進。科學家對於多樣性數據庫的期望包括標準數據格式、簡單易用的數據提交工具、提高數據質量、數據庫間的交互和協調等。
針對調查反應出來的問題,論文給出了相應的建議,比如:利用統一數據標識符(DOI)可以解決數據所有權和計算引用的問題;研究結構和資助機構應該更多地鼓勵數據分享並提供詳細的分享指南;數據庫和期刊采用更加合理和嚴格的數據保存政策;數據庫應更多地考慮數據提供者和使用者的夙求,提高數據庫的可操作性和數據質量。
該國際性調查研究首次關注作為生物多樣性數據分享者和使用者的科學家們的看法,結果對於研究結構和資助機構的科學決策,以及科學家、數據庫、期刊的數據共享實踐有重要的參考價值,所獲得的數據集也有重要價值。為了踐行數據分享,研究團隊已將所獲得的原始數據集和十八頁評論在網絡上共享。
相關文章及鏈接:
1. Xiaolei Huang, Bradford A. Hawkins, Fumin Lei, Gary L. Miller, Colin Favret, Ruiling Zhang, Gexia Qiao*. 2012. Willing or unwilling to share primary biodiversity data: results and implications of an international survey. Conservation Letters, doi: 10.1111/j.1755-263X.2012.00259.x (http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1755-263X.2012.00259.x/abstract)
2. Xiaolei Huang, Gexia Qiao*. 2012. Biodiversity data sharing is not just about species names: response to Santos and Branco. Trends in Ecology & Evolution, 27: 7-8. (http://www.cell.com/trends/ecology-evolution/fulltext/S0169-5347(11)00301-6)
3. Xiaolei Huang, Gexia Qiao*. 2011. Biodiversity databases should gain support from journals. Trends in Ecology & Evolution, 26: 377-378. (http://www.cell.com/trends/ecology-evolution/fulltext/S0169-5347(11)00139-X)

