張金陽，博士，副研究員。主要研究方向為非編碼RNA相關計算方法學開發，利用生物組學大數據探索非編碼RNA的組成結構及調控功能。以第一/通訊（含共同）作者在Nature Biotechnology，Nature Cell Biology，Nature Communications，Nucleic Acids Research，Nature Protocols，Advanced Science，Trends in Biochemical Sciences等學術期刊發表論文11篇，多個工作入選ESI高被引論文。研究成果入選2019與2021年度中國生物信息學十大進展。獲得中國科學院院長特別獎、北京市優秀畢業生、中國科學院優秀博士學位論文。作為項目負責人，主持國家自然科學基金項目2項，2022年度博士後創新人才支持計劃，博士後第72批麵上資助項目及中國科學院特別研究助理資助項目。

教育經曆：

2011.09 - 2015.07，北京大學生命科學學院，生物科學專業，本科

2015.09 - 2021.07，中國科學院大學生命科學學院（北京生命科學研究院），遺傳學專業，博士

工作經曆：

2021.08 – 2023.07，必威精装版app西汉姆联 ，特別研究助理（博士後）

2023.07 - 至今，必威精装版app西汉姆联 ，副研究員

圍繞非編碼RNA的組成結構及調控功能問題，開發新型生物信息學分析算法及實驗技術，高效解析環形RNA組成和結構，並利用人工智能模型探究環形RNA的生成調控機製與生物學功能。

1. Zhang J^#, Hou L^#, Ma L^#, Cai Z, Ye S, Liu Y, Ji P, Zuo Z, Zhao F. Real-time and programmable transcriptome sequencing with PROFIT-seq. Nature Cell Biology, 2024, (Accepted)
2. Zhou Z^#, Zhang J^#, Zheng X, Pan Z, Zhao F*, Gao Y*. CIRI-deep Enables Single-cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Circular RNAs with Deep Learning. Advanced Science, 2024, 11, e2308115
3. Wu W, Zhao F*, Zhang J*. circAtlas 3.0: a gateway to 3 million curated vertebrate circular RNAs through a standardized nomenclature scheme. Nucleic Acids Research, 2023, gkad770
4. Hou L^#, Zhang J^#*, Zhao F*. Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long. Nature Protocols, 2023, 18, 1795–1813
5. Wu W^#, Zhang J^#, Zhao F. Exploring the cellular landscape of circular RNAs using full-length single-cell RNA sequencing. Nature Communications, 2022, 13, 3242.
6. Chen S^#, Cao X^#, Zhang J^#, Wu W, Zhang B, Zhao F. circVAMP3 drives CAPRIN1 phase separation and inhibits hepatocellular carcinoma by suppressing c-Myc translation. Advanced Science, 2022, 9(8): e2103817.
7. Chen S^#, Zhang J^#, Zhao F. Screening linear and circular RNA transcripts from stress granules. Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2022
8. Zhang J & Zhao F. Characterizing circular RNAs using nanopore sequencing. Trends in Biochemical Sciences. 2021, 46, 785–786
9. Zhang J & Zhao F. Reconstruction of circular RNAs using Illumina and Nanopore RNA-seq datasets. Methods, 2021, 196, 17–22
10. Zhang J^#, Hou L^#, Zuo Z^#, Ji P, Zhang X, Xue Y, Zhao F. Comprehensive profiling of circular RNAs with nanopore sequencing and CIRI-long. Nature Biotechnology, 2021, 39, 836–845.
11. Zhang J, Chen S, Yang J, Zhao F. Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform switching events. Nature Communications, 2020, 11(1), 90.