| 姓 名： | 金堅石 |
|---|---|
| 學 科： | 生物技術/基因組學/分子生物學 |
| 電話/傳真： | +86-10-64807550 / |
| 電子郵件： | jinjs@ioz.ac.cn |
| 通訊地址： | 北京市朝陽區北辰西路1號院5號 必威精装版app西汉姆联
農業蟲害鼠害綜合治理研究國家重點實驗室 100101 |
| 更多信息： | 菌群生物學與智能調控研究組 |
簡曆介紹：
金堅石，博士，研究員，博士生導師；必威精装版app西汉姆联 農業蟲害鼠害綜合治理研究國家重點實驗室菌群生物學與智能調控研究組組長。
2009年和2014年分別獲得南京大學學士和北京大學博士學位。2010-2011前往哈佛大學訪問學習。2014-2016年在北京大學生命科學學院從事博士後研究。2016-2023年在日本理化學研究所先後擔任JSPS fellow、Research Scientist、Senior Scientist。
主要從事單細胞測序、顯微成像和智能化係統等的研發工作，研究腸道菌群和轉錄調控等複雜係統相關的生物學問題。研究成果發表於Science，Nature Communications, Nature Protocols, Science Immunology，PNAS，The Journal of Immunology等雜誌。已申請多國PCT專利。曾獲得日本理化學研究所“櫻舞賞”，日本JSPS博士後獎學金，北京大學優秀博士論文，北大-清華生命科學聯合中心優秀博士後基金等。
研究領域：
菌群在生態係統中處於非常重要的地位，不但參與環境中能量和物質的循環，同時也對宿主（如動物）的健康和疾病至關重要。這為利用菌群預測或控製農業有害動物爆發、保護生物多樣性、改善人類健康和生活質量等提供了新思路。本課題組將通過研發和應用基於大數據采集與分析的精確技術，特別是基於測序和成像的單細胞技術，從環境或共生菌群發現重要的功能微生物並研究其生物學，在此基礎上結合人工智能和生物技術實現對菌群的精準調控，同時為調控動物的繁殖與行為、改善環境或宿主健康等提出理論或開發具體技術。
社會任職：
獲獎及榮譽：
承擔科研項目情況：
國家重點研發計劃課題，主持，2023-2026
日本理化學研究所獎勵研究基金，主持，2020-2022
日本學術振興會外國人特別研究員獎勵基金，主持，2017-2019
日本學術振興會啟動專項基金，主持，2016-2017
代表論著：
（#通訊作者 *共同第一作者）：
12. Jianshi Jin#, Reiko Yamamoto, Katsuyuki Shiroguchi#, High-throughput identification and quantification of bacterial cells in the microbiota based on 16S rRNA sequencing with single-base accuracy using BarBIQ. Nature Protocols, 2023, https://doi.org/10.1038/s41596-023-00906-8.
11. Jianshi Jin*, Taisaku Ogawa*, Nozomi Hojo, Kirill Kryukov, Kenji Shimizu, Tomokatsu Ikawa, Tadashi Imanishi, Taku Okazaki, Katsuyuki Shiroguchi, Robotic data acquisition with deep learning enables cell image-based prediction of transcriptomic states. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 120 (1), e2210283120, 2023.
10. Guangwei Cui, Akihiro Shimba, Jianshi Jin, Nozomi Hojo, Takuma Asahi, Shinya Abe, Aki Ejima, Shinri Okada, Keizo Ohira, Ryoma Kato, Shizue Tani-ichi, Ryo Yamada, Takashi Ebihara, Katsuyuki Shiroguchi, Koichi Ikuta, CD45 alleviates airway inflammation and lung fibrosis by limiting expansion and activation of ILC2s. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 120 (36), e2215941120, 2023.
9. Sonoko Takahashi, Sotaro Ochiai, Jianshi Jin, Noriko Takahashi, Susumu Toshima, Harumichi Ishigame, Kenji Kabashima, Masato Kubo, Manabu Nakayama, Katsuyuki Shiroguchi, and Takaharu Okada, Sensory neuronal STAT3 is critical for IL-31 receptor expression and inflammatory itch. Cell Reports, 113433, 2023.
8. Jianshi Jin, Reiko Yamamoto, Tadashi Takeuchi, Guangwei Cui, Eiji Miyauchi, Nozomi Hojo, Koichi Ikuta, Hiroshi Ohno, Katsuyuki Shiroguchi, High-throughput identification and quantification of single bacterial cells in the microbiota. Nature communications, 13:863, 2022.
7. Guangwei Cui, Akihiro Shimba, Jianshi Jin, Taisaku Ogawa, Yukiko Muramoto, et al. A circulating subset of iNKT cells mediates antitumor and antiviral immunity. Science Immunology, 7, eabj8760, 2022.
6. Yanmeng Li, Jianshi Jin, Fan Bai, Cancer biology deciphered by single-cell transcriptomic sequencing, Protein Cell, 13(3):167–179, 2022.
5. Katsuyuki Shiroguchi *, Jianshi Jin*, and Reiko Yamamoto, Method for treating cell population and method for analyzing genes included in cell population. Application No.: PCT/JP2021/020338.
4. Jianli Tao*, Xiao-Wei Zhang*, Jianshi Jin*, Xiao-Xia Du, Tengfei Lian, Jing Yang, Xiang Zhou, Zhengfan Jiang and Xiao-Dong Su, Nonspecific DNA Binding of cGAS N Terminus Promotes cGAS Activation. The Journal of Immunology, 198(9):3627-3636, 2017.
3. Jianshi Jin*, Tengfei, Lian*, Chan Gu*, Kai Yu, Yi Qin Gao & Xiao-Dong Su, The effects of cytosine methylation on general transcriptional factors. Scientific Reports, 6:29119, 2016.
2. Jianshi Jin, Tengfei, Lian, X. Sunney Xie, Xiao-Dong Su, High-accuracy mapping protein binding stability on nucleosomal DNA using single-molecule method. Journal of Molecular Cell Biology, 6(5):438-40, 2014.
1. Sangjin Kim,* Erik Brostromer,* Dong Xing,* Jianshi Jin,* Shasha Chong, Hao Ge, Siyuan Wang, Chan Gu, Lijiang Yang, Yi Qin Gao, Xiao-dong Su, Yujie Sun, X. Sunney Xie, Probing Allostery Through DNA, Science, 339:816-819, 2013.
寫給考生的話：
樂觀麵對挫折，坦然麵對成績！多堅持一下或許你就成功了！
