鳥類學研究組有關鳥類適應青藏高原特殊環境的基因組學證據的研究成果在Nature Communications發表

地山雀(Parus humilis)是青藏高原的特有鳥種,屬山雀科鳥類。由於其形態特征與地鴉相近,曾長期被認為是鴉科鳥類,並被命名為“褐背擬地鴉”。動物進化與係統學院重點實驗室雷富民研究員領導的鳥類學研究組與諾禾致源合作,對地山雀開展全基因組de novo測序,同時對另外兩種山雀(大山雀和黃頰山雀)以及黑尾地鴉進行了重測序比較分析。研究結果從基因組水平進一步確證了地山雀是“山雀”而非“鴉”的分類地位,並初步揭示了該物種適應青藏高原極端環境的遺傳印跡。結果顯示,地山雀與黃頰山雀、大山雀的親緣關係很近,估算分化時間在7.7-9.9個百萬年之間。通過與原雞、火雞和斑胸草雀的基因組數據比較,發現地山雀基因組中與能量代謝相關的基因家族發生了擴張,而與免疫和嗅覺相關的基因家族發生了收縮;通過對7190個直係同源基因的比對,發現與低氧反應和骨骼發育相關的基因經曆了正向選擇以及不同程度的快速進化。上述結果進一步揭示了地山雀為適應青藏高原的特殊環境,產生了基本的生存適應策略演化,以及由山雀向鴉的形態特征轉變。

該成果於2013年7月1日在線發表於 Nature Communications雜誌(doi:10.1038/ncomms3071)(論文鏈接)。

本研究得到國家傑出青年科學基金(30925008),重大國際合作基因(31010103901)以及必威在线网址 生命科學領域“十二五”基礎前沿研究專項(KSCX2-EW-J-2)等的資助

對68個單拷貝直係同源基因的係統發育分析,揭示了地山雀與大山雀和黃頰山雀比黑尾地鴉具有更近的親緣關係。其分化時間(紅色數據)及支持率(節點上部)見圖中的相應標識。
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