甲型流感為急性呼吸道傳染病，其病原體是一種新型的甲型H1N1流感病毒，在人群中傳播。自2009年開始，甲型H1N1流感在全球範圍內大規模流行。2010年8月，世衛組織宣布甲型H1N1流感大流行期已經結束。2012年我國甲型H1N1流感病例超過300例，由於流感病毒經常發生抗原漂移，因此經常發生規模大小不等的暴發流行。何宏軒研究員領導的野生動物疫病研究組2009年在科學通報上發表了甲型H1N1北美毒株特征（Chinese Sci Bull, 2009），證明了甲型H1N1流感的變異和進化，對於人類呈現高親和力、低致病性、不具有高致病性流感病毒的特性、對神經氨酸酶抑製劑類藥物敏感，但對金剛烷胺類藥物具有抗性等4大特征。近期又對甲型流感爆發以來H1N1病毒所有片段進行了選擇壓力分析，結果發現除NS片段外其餘7個片段的編碼區都呈現明顯的負選擇壓力，表明它們對人是比較適應的。

NS片段是流感病毒的最小片段，其編碼NS1和NS2兩個蛋白，分析發現NS1片段也呈現負選擇壓力，而NS2片段則在流感剛剛爆發的4月呈現出明顯的正選擇壓力，因此認為NS片段極有可能在以前感染人H1N1病毒中從未出現過，在2009H1N1病毒中出現對於甲型流感進入人體並導致疫情爆發可能具有一定的作用，而另一個不同尋常之處在於2009年8月的病毒NS2片段再次表現出明顯的正選擇壓力，這與一般的病毒跨宿主傳播的遺傳進化理論不符，對於這一奇怪現象，認為這與7月份以後甲流病毒傳播速度和傳播範圍的急速擴大有關係，病毒接觸到的群體數量、群體多樣性都大為增加，因此病毒在進化過程中再一次受到了正選擇壓力，進一步表明NS片段是2009年前後重組到人流感病毒基因組的可能性。

NS片段的遺傳突變網絡分析，甲型流感病毒自四月份出現以來，就以兩個基礎的突變型（G1型,123V 和G2型,123 I）為原點進行進化，這個變異的位點處於NS1的編碼區。出現這一現象有兩種可能，一是在病毒最初傳播到人宿主時就是以兩個突變型的形式先後傳入的，該突變可能在甲流未傳入人的時候就已經出現，因為這兩個基本突變性出現的時間都非常早，同時又分別都有大量的感染群體和後期進化毒株的出現；二是病毒先以G1或G2中的一種進入人體，而後另外一種由原始突變型進化而來，但顯然該位點的突變使病毒獲得了明顯的感染傳播優勢，在短期內形成了龐大感染群體。

綜上所述，認為NS片段是這次甲型流感暴發過程中的一個極為特殊的片段，很有可能對甲流爆發以及蔓延起到了重要的作用。這一研究結果發表在PloS ONE雜誌上。該項目獲得了國家自然科學基金青年基金，中科院知識創新工程等項目的支持。

Wang C, Zhang Y, Wu B, Liu S, Xu P, et al. (2013) Evolutionary Characterization of the Pandemic H1N1/2009 Influenza Virus in Humans Based on Non-Structural Genes. PLoS ONE 8(2): e56201. doi:10.1371/journal.pone.0056201.(原文鏈接)

Mutation network for the NS geneof the novel influenza virus A (H1N1). Mutation networks for the NS gene on Apr 2009 (A), Apr to Jun 2009 (B), Apr to Oct 2009 (C), and Apr 2009 to May 2010 (D). The trend of the two prevalent genotypes (G2 and G1 type) remained unchanged from April 2009 to May 2010.